沙门氏菌通常不会给爬虫带来多大的伤害，但它确能诱发很多人类疾病。
几乎所有爬虫都带有沙门氏菌，它们寄生在爬虫的消化道中并会随粪便一起被排出体外。当你用手接触过爬虫以后，这些菌很有可能已转移到你的手上，如果此时你用手去拿食物吃，那么这些菌便会被你摄入体内并引起霍乱，发热等疾病，严重时，沙门氏菌会进入血液，骨髓甚至神经系统并引发致命疾病。对婴儿以及免疫功能受损（如接受过骨髓移植或化疗）的成年人来说，感染沙门氏菌是相当危险的。
爬虫学家曾尝试通过注射抗生素药物来清除爬虫体内的沙门氏菌，这一方法并无多大进展，带有药物抗体的新菌种很快就诞生了，由此看来，从爬虫本身来控制沙门氏菌的传播几乎没有可能。不过防止沙门氏菌从爬虫传递到人体是相当容易的，以下是一些方法及注意事项：
- 在接触过爬虫，爬虫粪便以及爬虫饲养区内的器材或其它物品后，用热水或盐水清洗双手
- 不要让爬虫同餐具接触，或者你根本就不要把爬虫带入厨房
- 不要一手拿着爬虫，一手在吃东西或吸烟
- 不要在厨房的水槽中给爬虫泡澡或清洗爬虫器材
- 切忌让婴儿及年幼的小孩同爬虫或者爬虫触碰过的物品接触
- 免疫力受损的成年人也不应当同爬虫接触
沙门氏菌只能经口进入人体，因此仅触摸或捉拿爬虫并不会受到感染。